Export Il-62 probíhal do mnoha zemí, včetně Československa, Angoly, Maďarska, NDR, KLDR, Číny, Kuby, Mosambiku, Polska, v mnoha zemích sloužil pro přepravu prezidenta země.

Od 90. let začalo vyřazování letadel, po roce 2000 se začaly využívat spíš pro přepravy nákladů. Aeroflot přestal používat Il-62 v roce 2005.

V České republice létal Il-62 ještě v 90. letech, vyřazené stroje přešly i k soukromým dopravcům v ČR, později byly některé prodány do Ruska a jinam na východ. Poslední přelet proběhl v roce 2001.

V roce 2020 provozují Il-62 tři letecké společnosti – Air Koryo pro přepravu cestujících, íránská společnost Aria Air pro přepravu cestujících.

Rada Airlines z Běloruska používá Il-62 pro převoz nákladů, v roce 2020 letěl i do Pekingu, Velké Británie a dalších míst po světě. V listopadu 2020 zakoupily Rada Airlines další Il-62 od letecké společnosti z Kazachstánu, umístěný však na kazaňském letišti od roku 2017. 20. prosince 2020 začalo letadlo pravidelně přepravovat náklady (Indonésie, Egypt, Francie, Velká Británie, Kyrgyzstán, Kazachstán, Čína – výčet jen za poslední dny roku 2020).

Ze státních organizací používají Il-62 stále u vládní letky v KLDR a Vzdušné síly RF.